Поступил в аспирантуру, отсрочка ушла в военкомат

Я бы не рисковал

http://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_34661/b579e6b98d04339110a9676dd035147862ff91e0/
вот это и будет

В очередной раз убеждаюсь, что в армии реально делать нехер человеку с высшим образованием

Откуда у тебя возьмется отсрочка, если ты не пройдешь в военкомате все призывные мероприятия?! А та бумажка, которую прислали в военкомат из твоего ВУЗа это всего лишь справка о том, что ты там учишься и не более того. А отсрочку дает своим решением только призывная комиссия, причем только после определения твоей годности в ходе прохождения ВВК. Ведь если тебя признают негодным, тогда зачем тебе отсрочка?

У Вас только право на отсрочку, а чтобы её получить надо пройти мед. комиссию. После этого призывная комиссия решит - давать Вам отсрочку или не давать.

Вот вроде аспирант уже, а мозгов нет совсем, отсрочка никуда сама не ходит, это решение призывной комиссии которое должны по тебе вынести после медосвидетельствования и предоставления всех необходимых документов (копия диплома, возможно выписка из приказа о зачислении). Даже если учебное заведение справку Приложение2 отправит в военкомат отсрочки у тебя не будет пока не оформишь.