Сколько максимально консульство может хранить паспорт, если подающий д-ты на визу не заберет его в назначенный срок?

Определяется внутренними документами конкретного консульства (общего стандарта нет).

все документы забираются не в консульстве а отправляются вам или визовому центру-агентству почтой, вы за эту доставку проплачиваете при подаче, нафиг кому упали ваши паспорта и их хранение