Как использовать прокси-сервер для скачивания больших файлов с облака mail.ru с помощью программы Download Master?

Вам там на Украине надо будет завести VPN, чтобы обойти ограничения украинских провайдеров.
Лучше использовать платные, но для вас сойдут и бесплатные.
Как только у вас ip-адрес будет не украинский, у вас все будет качать, как вы ожидаете.
А настройки прокси-сервера - это не для вас, это в некоторых организациях хитро организован доступ в интернет для сотрудников, чтобы работодатель знал, кто сколько мегабайт накачал и куда он ходил. Вам, для скачивания файлов с Облака Майла, это не поможет. И да, там для такого дела нужен платный акк Облака. На бесплатном вы сможете качать только через wen-интерфейс.