Хочу, чтобы дерево стало частью архитектуры дома, а по СНИП расстояние от дерева до дома должно быть 5 метров..

А Деньги у тебя есть? Тогда-способ решить данную проблему есть. Он прост до банальности. Строишь свой дом в соответствии с разработанными специализирующейся организацией СТУ. СТУ находятся во главенстве над СНИПами и т. п.
При проектировании и строительстве по СТУ - нормы СНИПов не учитываются.

Порядок получения разрешения-не слишком сложен, да и занимаются получением обычно те, кто проектировал. Ты только подписи на заявлении ставишь.

Для меня, например, сумма в полляма на СТУ для дома в 150 квадратов-великовата. Забил. Но для тебя может быть и адекватной.