Непонятна взаимосвязь между увеличением ящика и потерей писем.
Поэтому: разобьем ваш вопрос на два.
Объем почтового ящика увеличивается автоматически, когда заполненность вашего ящика превышает 95% (или 90, не помню точно).
Про утерянность важных писем:
\- убедитесь, что вы зашли в тот ящик, в котором эти письма должны быть. Разные почтовые ящики - разные письма в нем.
\- если вы уверены, что ящик правильный и письма там были, то идете в настройки почтового ящика, и в разделе "Безопасность" смотрите историю посещения вашего почтового ящика.
https://e.mail.ru/settings/securityВ истории посещений ищете строчку про удаление писем. Находите её и читаете, кто, когда, во сколько и откуда произвел это действие. Делаете выводы. Если вы выводы сделать не можете, то попробуйте написать мне в комментарий.